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苹果手机短信被过滤可能指的是被系统或第三方应用过滤为垃圾短信或者广告短信。关于短信的去向和如何查询，以下是一些建议。
1、垃圾短信或广告短信可能被存放在“过滤信息”或“拦截短信”文件夹中，可以在手机短信应用内查找这些文件夹，查看被过滤的短信。
2、如果使用了第三方短信应用，如WhatsApp或其他应用，这些应用可能也有自己的垃圾短信过滤功能，在这种情况下，需要登录应用的设置或偏好设置来查找被过滤的短信。
3、如果怀疑短信被过滤是因为某些特定的关键词或内容，可以尝试更改短信过滤设置或检查是否有特定的过滤规则，这些设置通常在手机的设置菜单中的“信息”或“短信”部分。
4、如果仍然无法找到被过滤的短信，可能需要检查是否有其他安全或隐私应用（如隐私保护工具）影响了短信的正常显示，这些应用可能也会有自己的过滤功能。
5、如果以上方法都不奏效，可以考虑使用iTunes或iCloud备份恢复功能来找回可能被误删的短信，但这种方法的前提是之前已经开启了备份功能。
具体的操作可能会因手机型号和系统版本的不同而有所差异，如果仍然无法找到被过滤的短信，建议联系苹果官方客服寻求帮助，请注意保护个人隐私和安全，避免泄露敏感信息。